Nach Studien in Schulmusik, Klavier, Jazz und Orchesterdirigieren in Stuttgart, Karlsruhe und Lissabon war Christoph JK Müller als Korrepetitor und Kapellmeister an der Staatsoper Stuttgart und der Oper Dortmund engagiert. Darüber hinaus gastierte er u.a. am Pfalztheater Kaiserslautern, an der Oper Bonn und beim Brandenburgischen Staatsorchester Frankfurt (Oder). Vom Schul- bis zum professionellen Konzert- und Opernorchester, vom Kirchen- über Universitätschor zu Opernchöre - Christoph JK Müller baut auf zahlreiche Erfahrungen in allen Leistungsbereichen, die seine Arbeit durch ihre Vielseitigkeit sehr bereichert. Neben seiner Tätigkeit als Dirigent ist er leidenschaftlicher Klavierimprovisator, seine Arrangements und Kompositionen erscheinen regelmäßig im Carus-Verlag.
Seit dem Sommersemester 2022 ist Christoph JK Müller als Dozent für Orchesterleitung an der Universität der Künste Berlin tätig.